性質區別

醫用口罩多采用一層或者多層非織造布復合制作而成，主要生產工藝包括熔噴、紡粘、熱風或者針刺等，而活性碳口罩是有使用活性炭做為過濾材料的口罩，可以按外形，材料，工藝來分為不同種類。

使用范圍區別

醫用口罩適用于醫務人員和相關工作人員對經空氣傳播的呼吸道傳染病的防護，是一種密合性自吸過濾式醫療防護用品，防護等級高，尤其適用于診療活動中接觸經空氣傳播或近距離經飛沫傳播的呼吸道感染疾病患者時佩戴。而活性炭口罩是大家日常生活中使用比較廣泛的，這個口罩主要有防毒、除臭、濾菌、阻塵等功效，一般適用于有害氣體、霧霾、有害液體等刺激性氣體的場合。

使用次數區別

醫用口罩主要運用于醫院，大部分為一次性使用口罩，一般配戴4-8小時左右就要換，最多不能使用超過2次，而活性碳口罩則可以根據環境的具體情況，進行多次使用。

方便程度區別

醫用口罩的吸附性比較好，設計了可彎折鼻夾，保證了口罩與臉部得到密合但不利于折疊、攜帶，而活性炭口罩可折疊，易保存，自重輕，方便攜帶，只是相對來說封閉性較醫用口罩較差。