性狀不同
蟲草花：蟲草花是有天然培養基培養的一種菌類，其成品有孢子品和子實體的區別，但是它沒有“蟲體”，顏色金黃，形似植物花蕊。
冬蟲夏草：這種中藥材在冬天是蟲體，在夏季是植物，很是神奇，其實也是一種高蛋白菌類，主要以蟲體出售。
成分不同
冬蟲夏草：冬蟲夏草中含水分10.85%，脂肪8.50%，粗蛋白25.3%，粗纖維18.55%，碳水化物28.90%，灰分4.80%。脂肪含飽和脂肪酸13.00%，不飽和脂肪酸82.2%，蟲草酸約7%，以及冬蟲夏草素。
功效不同
蟲草花：在臨床上蟲草花雖然在使用，但是并未將其劃為中藥材，主要用以輔助治療眩暈耳鳴、健忘不寐、腰膝酸軟、久咳虛喘等癥。
冬蟲夏草：冬蟲夏草甘平保肺，益腎，補精髓，止血化痰，已勞咳，治膈癥皆良。
產地不同
蟲草花：蟲草花雖然是科學研究的成品，但是其生產地卻十分受氣候的限制，目前鍋內主要是以新會和沈陽在種植蟲草花。
冬蟲夏草：這類自然界生長的菌類在我國很多地區都有分布，但是主要幾種在我國青海、西藏、四川、云南、貴州、甘肅等海拔在3500~5000米的高原地區。
價格不同
蟲草花：蟲草花是科學研究的成品，其價格并不是很貴，一般在100~1000元/斤，平常家庭都可食用。
冬蟲夏草：冬蟲夏草是目前中藥中最貴的一類，其價格在10W以上，產地和藥物的品質決定其價格的上漲。