甲癬通常可以通過直接鏡檢、真菌培養、組織病理檢查等真菌檢查可得出診斷。同時可以結合病甲表現如：渾濁、增厚、表面凹凸不平、變脆易碎、甲分層、變色、甲溝炎等可以輔助診斷。

1.甲下型甲癬：在病甲中取樣做PAS染色易找到真菌，在甲板層中可見菌絲及關節孢子，甲質松解，常位于甲板的最下部。

2.真菌性白甲：真菌菌絲只局限于甲板的最上部位，很少波及較深層。甲板上部可見大量菌絲及關節孢子。

3.念珠菌性甲真菌病：通常伴有甲溝炎，在甲溝及甲床內碎屑切片中可見有菌絲。酵母菌所致的甲真菌病甲在其疏松組織中可找到真菌。