黃連為多年生草本。根莖黃色，常分枝，密生多數須根。葉全部基生；葉柄長5-12（-16）cm；葉片堅紙質，卵狀三角形，寬達10cm，3全裂；中央裂片有細柄，卵狀菱形，長3-8cm，寬2-4cm，頂端急尖，羽狀深裂，邊緣有銳鋸齒，側生裂片不等2深裂，表面沿脈被短柔毛。蓇葖果6-12，長6-8mm，具細柄。種子7-8粒，長橢圓形，長約2mm，寬約0.8mm，褐色。花期2-4月，果期3-6月。